11月8日,記者從中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所(嶺南現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學(xué)與技術(shù)廣東省實(shí)驗(yàn)室深圳分中心)了解到,該所周永鋒團(tuán)隊(duì)提出了一種利用人工智能進(jìn)行葡萄育種的新方法。這種方法預(yù)測(cè)準(zhǔn)確率高達(dá)85%,能大幅縮短育種周期,有望實(shí)現(xiàn)葡萄的精準(zhǔn)育種設(shè)計(jì),并為其他多年生作物育種提供方法參考。相比傳統(tǒng)方法,新方法使育種效率提高400%。相關(guān)研究成果日前發(fā)表在國(guó)際期刊《自然·遺傳學(xué)》上。
全面、準(zhǔn)確的基因組數(shù)據(jù)是精準(zhǔn)設(shè)計(jì)育種的基礎(chǔ)。為深入挖掘基因組數(shù)據(jù),周永鋒團(tuán)隊(duì)引入機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù),構(gòu)建預(yù)測(cè)模型。團(tuán)隊(duì)根據(jù)該模型的評(píng)分進(jìn)行早期個(gè)體的預(yù)測(cè)和選擇,從而優(yōu)化育種策略。
周永鋒介紹,在本研究中,研究人員將包含性狀和基因型的數(shù)據(jù)劃分為訓(xùn)練集、驗(yàn)證集和測(cè)試集3個(gè)子集,利用機(jī)器學(xué)習(xí)算法解析基因型與性狀數(shù)據(jù)間復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系。該研究運(yùn)用訓(xùn)練數(shù)據(jù)集構(gòu)建了首個(gè)葡萄全基因組選擇模型,然后進(jìn)一步通過驗(yàn)證數(shù)據(jù)集調(diào)整模型參數(shù),對(duì)模型進(jìn)行優(yōu)化,最后使用測(cè)試數(shù)據(jù)集評(píng)估最終模型的性能。
周永鋒說,通過這一模型,育種工作者可快速準(zhǔn)確地評(píng)估大量育種材料的遺傳潛力,從而更好地選擇優(yōu)良品種。該模型在葡萄育種中有很大應(yīng)用潛力,有望提高葡萄育種效率,加速葡萄新種質(zhì)創(chuàng)制,革新葡萄育種策略。目前,相關(guān)研究成果已申請(qǐng)獲批國(guó)家發(fā)明專利6項(xiàng),并申請(qǐng)國(guó)際專利1項(xiàng)。